En ese 2005 ingresa como gerenciador Carlos Granero, quien arma un equipo, con Castagno Suárez, Luciano Leguizamón, Zárate, el retorno al club de Cuenca, Bustamante, Oyola, camiseta valencia 24 25 que en el Apertura 2005 le alcanza para quedarse en la B Nacional. En enero de 2008 Carlos Ahumada compra el 70 % de las acciones del club al gerenciador Carlos Granero, quien se convirtió en el nuevo gerenciador Albiazul. Allí se nombró el órgano fiduciario, a cargo del juez Carlos Tale, que primero llamó al fideicomiso y luego dio intervención al fondo inversor que preside Rodrigo Escribano pero que tiene como hombre fuerte al famoso empresario Aldo Roggio. En septiembre de 2009, en plena competencia en este torneo, el juez que manejaba la quiebra del club, Carlos Tale, decide retirar el gerenciamiento a Carlos Ahumada, por lo cual se volvió al manejo del fideicomiso. Aitor y Bartra corrieron a celebrar el gol mostrando una bandera de la Comunidad Valenciana con un crespón negro en un gesto que levantó de sus asientos al público de Mestalla. En el mes de enero de 2021, cerca de la fecha exacta del aniversario, el equipo sacó un nuevo himno cantado por Mikel Izal en una doble versión en euskera y castellano llamado ‘Alta la frente’ en español y ‘Gora burua’ en euskera.
La pretemporada tuvo 3 etapas al mando del director técnico Frank Darío Kudelka, la primera en Alta Gracia, la segunda en Santa Fe y la tercera en México con amistosos con el Club León, camiseta fútbol el Tlaxcala Fútbol Club y Mineros de Zacatecas. Talleres se salvó del descenso directo en la última fecha contra Tiro Federal, pero no pudo evitar la promoción ante Club Atlético Racing de Córdoba, a quien venció 3 a 2 en el global. Así, debió disputar la Promoción, en la que cayó ante Argentinos Juniors por 2 a 1 en ambos partidos y descendió después de seis años a la Primera B Nacional. Fue un fijo en el once durante toda la temporada, jugando casi el mismo número de partidos como lateral que como extremo diestro. 16 puntos (4 partidos ganados 4 empatados y 2 perdidos) jugó la tercera fase con partidos de ida y vuelta en el cual consiguió agónicamente pasar a la siguiente ronda y dejar a Racing de Córdoba afuera por ventaja deportiva (ya que Racing terminó penúltimo (undécimo) ya que en los 2 partidos disputados entre ellos en esta fase fueron empatados por 1 a 1. En la próxima instancia Talleres se enfrentaba a Crucero del Norte donde en Córdoba empataron 0 a 0 y en Misiones el Colectivero dejó afuera a la «T» por 2 a 1, que logró ascender a la segunda división venciendo en la final del reducido al club Sportivo Belgrano, y en la promoción a Brown de Puerto Madryn.
En octavos de final, Santa Fe quedó eliminado a manos de las Chivas de Guadalajara, luego de que en la ida perdieran 3-0 y en el partido de vuelta en Bogotá se impusieran por 3-1, quedando eliminados con un marcador global de 4-3. Un factor determinante en dicha derrota fue el lamentable deterioro de la gramilla del Estadio Nemesio Camacho El Campín. En 2007 llegaría nuevamente Ricardo Gareca, junto con la vuelta del ídolo cordobés: Diego Garay; pero al no poder ganar en 9 partidos, sumado al mal juego del equipo, le significó su renuncia. En la última fecha, se retiró del club el ídolo, Rolando Schiavi, para jugar al Shanghái Shenhua. A fines de 2014 después de casi 10 años sin una comisión directiva propia por el estado de quiebra, el club empieza el levantamiento definitivo de esta y se le posibilita ir a las urnas para elegir a los sucesores del fondo de inversión. Se han notado los aportes de los integrantes de la fundación azul y blanco en el club ya sea en las inferiores tanto como en la habilitación del estadio «La Boutique» para 18.100 personas. El director técnico Arnaldo «Cacho» Sialle sacó durante todo el campeonato el 69,69 % de los puntos y terminó invicto el Undecagonal, consiguiendo así el ascenso para el club a la B Nacional y logrando que el club le renovara su vínculo.
El club retornó a la Primera B Nacional preparado para afrontar el torneo de transición con varios refuerzos, tanto nacionales como extranjeros. Esto se conoció como el desastre del Parque Burnden. Aunque esto ha sido negado por ambos jugadores, hasta la actualidad. Esto le deja a Talleres la otra estrella del escudo. Talleres vuelve a hacer otro apertura excepcional, finalizando cuarto con 36 puntos, a 5 del Boca Campeón del Mundo de Bianchi. En 2005, Toyota fue la cuarta mayor empresa de automóviles en el mundo en términos de ventas con $135.820 millones-tras General Motors con $185.520 millones, Ford con $164.200 millones y DaimlerChrysler con $157.130 millones. 6-0 (marcaron José Giarrizo en 4 ocasiones y José Américo Montanini en 2), mientras que la mayor goleada ocurrida en el General Santander a favor del «Leopardo» fue el 26 de mayo de 1960 por 5-1 (marcaron Abraham González y Américo Montanini en 2 oportunidades y Marcos Coll en una). La lista ganadora estaba encabezada por Andrés Fassi como presidente y Rodrigo Escribano, José Tanus Rufeil y Néstor Quiñones como vicepresidentes primero, segundo y tercero, respectivamente. En mayo de 2013 Talleres volvería a la B Nacional de la mano de Arnaldo Sialle habiendo tenido 6 técnicos distintos en su estadía en la tercera división argentina; a saber: Roberto Saporiti, Andrés Rebottaro, Héctor Arzubialde, Gustavo Coleoni, «Chaucha» Bianco y por último el histórico Arnaldo «Cacho» Sialle.
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